دندانپزشک ابتدا دندان را با استفاده از بی حسی موضعی بی حس می کند تا کودک در حین درمان دردی احساس نکند. پس از آن دندانپزشک  با دستگاه مخصوص به محفظه عفونی پالپ دسترسی پیدا می کند و عصب های داخل دندان با دستگاهی به نام فایل بریده و برداشته می شود. پس از انجام مراحل فوق كانال ریشه با محلول هیپوکلرت سدیم شسته شده و پس از ان دندان با مواد مخصوص پر می شود.

علت اصلی استفاده از این روش در کودکان این است که بعد از افتادن دندان شیری لثه آماده می شود تا دندان دائمی شروع به بالا امدن کند. زمانی که شرایطی پیش می اید که دندان شیری دچار اسیب شده یا باید زودتر ازموعد کشیده شود لازم است ریشه دندان شیری دوباره توسط بدن جذب گردد. موادی که در پالپکتومی استفاده می شوند این قابلیت را دارند تا توسط بدن دوباره جذب شده در نتیجه کمک به رشد بهترو راحت تر دندان دائمی می کنند.